Automated extraction of information from free text of Spanish oncology pathology reports

Background: Pathology reports are stored as unstructured, ungrammatical, fragmented, and abbreviated free text with linguistic variability among pathologists. For this reason, tumor information extraction requires a significant human effort. Recording data in an efficient and high-quality format is essential in implementing and establishing a hospital-based-cancer registry Objective: This study aimed to describe implementing a natural language processing algorithm for oncology pathology reports. Methods: An algorithm was developed to process oncology pathology reports in Spanish to extract 20 medical descriptors. The approach is based on the successive coincidence of regular expressions. Results: The validation was performed with 140 pathological reports. The topography identification was performed manually by humans and the algorithm in all reports. The human identified morphology in 138 reports and by the algorithm in 137. The average fuzzy matching score was 68.3 for Topography and 89.5 for Morphology. Conclusions: A preliminary algorithm validation against human extraction was performed over a small set of reports with satisfactory results. This shows that a regular-expression approach can accurately and precisely extract multiple specimen attributes from free-text Spanish pathology reports. Additionally, we developed a website to facilitate collaborative validation at a larger scale which may be helpful for future research on the subject.

Introducción: Los reportes de patología están almacenados como texto libre sin estructura, gramática, fragmentados o abreviados, con variabilidad lingüística entre patólogos. Por esta razón, la extracción de información de tumores requiere un esfuerzo humano significativo. Almacenar información en un formato eficiente y de alta calidad es esencial para implementar y establecer un registro hospitalario de cáncer. Objetivo: Este estudio busca describir la implementación de un algoritmo de Procesamiento de Lenguaje Natural para reportes de patología oncológica. Métodos: Desarrollamos un algoritmo para procesar reportes de patología oncológica en Español, con el objetivo de extraer 20 descriptores médicos. El abordaje se basa en la coincidencia sucesiva de expresiones regulares. Resultados: La validación se hizo con 140 reportes de patología. La identificación topográfica se realizó por humanos y por el algoritmo en todos los reportes. La morfología fue identificada por humanos en 138 reportes y por el algoritmo en 137. El valor de coincidencias parciales (fuzzy matches) promedio fue de 68.3 para Topografía y 89.5 para Morfología. Conclusiones: Se hizo una validación preliminar del algoritmo contra extracción humana sobre un pequeño grupo de reportes, con resultados satisfactorios. Esto muestra que múltiples atributos del espécimen pueden ser extraídos de manera precisa de texto libre de reportes de patología en Español, usando un abordaje de expresiones regulares. Adicionalmente, desarrollamos una página web para facilitar la validación colaborativa a gran escala, lo que puede ser beneficioso para futuras investigaciones en el tema.

Complicaciones cardiovasculares asociadas a la acromegalia. Estado del arte / Cardiovascular complications associated with acromegaly. A state-of-the-art

Resumen La acromegalia es una enfermedad rara, causada principalmente por un tumor hipofisiario secretor de hormona de crecimiento (GH), se caracteriza por tener progresión lenta y asociarse a un compromiso multisistémico, siendo el aparato cardiovascular uno de los más comprometidos, llegando, incluso, desde hace más de 10 años a representar la principal causa de muerte. Las complicaciones cardiovasculares se desarrollan como resultado de las concentraciones sanguíneas elevadas de la GH y del factor de crecimiento similar a la insulina tipo 1 (IGF-1), los cuales ejercen efectos directos e indirectos sobre el endotelio, grandes vasos, riñón y los cardiomiocitos; produciendo hipertensión arterial, enfermedad valvular, arritmia cardiaca y una cardiopatía propia de la acromegalia denominada miocardiopatía acromegálica. Luego de la revisión bibliográfica actualizada relacionada con la fisiopatología, manifestaciones clínicas, diagnóstico y tratamiento del compromiso cardiovascular, encontramos que desde el punto de vista cardiovascular los pacientes con acromegalia pueden variar desde un estado asintomático hasta presentar disfunción cardiaca severa, siendo los marcadores bioquímicos y exámenes de imagen herramientas diagnósticas que permiten evaluar el grado de afección cardiovascular para poder brindar un tratamiento individualizado. La normalización de los valores de la GH y del IGF-1 mejora los parámetros cardiovasculares y, por tanto, su pronóstico.

Abstract Acromegaly is a rare disease, mainly caused by a pituitary tumor secreting growth hormone. It is characterized by slow progression and is associated with a multisystemic involvement, being the cardiovascular system, one of the most involved, even reaching, more than 10 years ago, to represent the main cause of death. Cardiovascular complications develop as a result of elevated blood concentrations of growth hormone and insulin-like growth factor 1, which exert direct and indirect effects on the endothelium, large vessels, kidney and cardiomyocytes; causing arterial hypertension, valve disease, cardiac arrhythmia and a specific heart disease called acromegalic cardiomyopathy. After the literature overview related to the pathophysiology, clinical manifestations, diagnosis and treatment of cardiovascular involvement, we found that from a cardiovascular point of view, patients with acromegaly can range from an asymptomatic state to severe cardiac dysfunction, being the biochemical markers and imaging studies diagnostic tools that allow assessment the degree of cardiovascular disease in order to provide individualized treatment. The normalization of growth hormone and insulin-like growth factor 1 levels improves cardiovascular parameters, and therefore its prognosis.

COVID-19 Outcome Prediction by Integrating Clinical and Metabolic Data using Machine Learning Algorithms

ABSTRACT Background: The coronavirus disease (COVID-19) is an infectious disease caused by the SARS-CoV-2 virus and is responsible for nearly 6 million deaths worldwide in the past 2 years. Machine learning (ML) models could help physicians in identifying high-risk individuals. Objectives: To study the use of ML models for COVID-19 prediction outcomes using clinical data and a combination of clinical and metabolic data, measured in a metabolomics facility from a public university. Methods: A total of 154 patients were included in the study. "Basic profile" was considered with clinical and demographic variables (33 variables), whereas in the "extended profile," metabolomic and immunological variables were also considered (156 characteristics). A selection of features was carried out for each of the profiles with a genetic algorithm (GA) and random forest models were trained and tested to predict each of the stages of COVID-19. Results: The model based on extended profile was more useful in early stages of the disease. Models based on clinical data were preferred for predicting severe and critical illness and death. ML detected trimethylamine N-oxide, lipid mediators, and neutrophil/lymphocyte ratio as important variables. Conclusion: ML and GAs provided adequate models to predict COVID-19 outcomes in patients with different severity grades.

Neoplasia sólida pseudopapilar de páncreas: una serie de cinco casos y revisión de la literatura / Solid pseudopapillary neoplasm of the pancreas: A series of five cases and a literature review

Resumen Introducción: las neoplasias sólidas pseudopapilares de páncreas representan alrededor del 3% de los tumores pancreáticos quísticos resecados. Se presentan con mayor frecuencia en mujeres jóvenes entre la segunda y tercera décadas de la vida. Es un tumor con poco potencial maligno que se ubica principalmente en la cola; sin embargo, puede encontrarse en cualquier localización anatómica pancreática. Métodos: se presentan 5 casos de cuatro mujeres y un hombre, entre 16 y 36 años, que consultaron principalmente por dolor abdominal. Resultados: cuatro pacientes fueron llevados a pancreatectomía distal sin esplenectomía por laparoscopia, y una paciente a pancreatoduodenectomía por laparotomía. Se logró extraer por completo y satisfactoriamente el tumor a los cinco pacientes. No se evidenció metástasis. Los tumores se localizaron en la cabeza (1), cuello (1) y predominantemente en cuerpo y cola (3). El reporte histopatológico posoperatorio confirmó el diagnóstico en los cinco casos, en la paciente más joven se había realizado una biopsia percutánea previa a la intervención quirúrgica. Conclusiones: la resección quirúrgica completa del tumor con preservación del bazo es el tratamiento de elección en pacientes con neoplasia sólida pseudopapilar de páncreas.

Abstract Introduction: Solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas represent around 3% of resected cystic pancreatic tumors. They occur more frequently in young women between the second and third decades of life. It is a tumor with little malignant potential located mainly in the tail; however, it can be found in any pancreatic anatomical location. Materials and methods: We reported five cases of four women and one man, between 16 and 36 years of age, who consulted mainly for abdominal pain. Results: Four patients underwent distal pancreatectomy without laparoscopic splenectomy, and one underwent laparotomy pancreatoduodenectomy. The tumor was completely and satisfactorily removed from all five patients. No metastasis was found. The tumors were located on the head (1), neck (1), and predominantly on the body and tail (3). The postoperative histopathological report confirmed the diagnosis in all five cases; in the youngest patient, a percutaneous biopsy had been performed before surgical intervention. Conclusions: Complete surgical resection of the tumor with preservation of the spleen is the treatment of choice in patients with solid pseudopapillary neoplasm of the pancreas.

Hora Dorada de neutropenia febril en cáncer pediátrico Hospital de Niños "J. M. de los Ríos"

Tratamientos intensificados se asocian con neutropenia severa, identificada como factor de riesgo de complicaciones infecciosas en pacientes con enfermedades neoplásicas. Objetivo: Evaluar la importancia del momento de inicio del tratamiento antibiótico en la evolución y pronóstico de pacientes con neutropenia febril (NF) por Cáncer ingresados al Hospital de Niños "J.M. de los Ríos" entre febrero 2020 ­ febrero 2022. Métodos: Estudio descriptivo, prospectivo, transversal, analítico, se registró formulario de recolección de datos y base de datos Google Drive para análisis estadístico por distribución de frecuencias y porcentajes. Se entregó Consentimiento y Asentimiento Informado a padres y pacientes, ambos aprobados por Comisión de Bioética, capacitándose en manejo de fiebre neutropénica. Incluyó pacientes con fiebre durante la primera hora después de recibir quimioterapia, indicándoseles antibióticos. Resultados: Sexo masculino 63,2 % (36/57) de los casos de NF y preescolares 43,9 % (25/57) fueron los más afectados. Leucemia Linfocítica Aguda fue el cáncer más frecuente 68,4 % (39/57) y Bacteriemia 40,4 % (23/57) la patología infecciosa predominante. Evolucionaron satisfactoriamente en la mayoría de los casos; la Media de la estancia hospitalaria fue 14,56 días, más prolongada en pacientes con Leucemia Linfocítica Aguda en fase de inducción. Gramnegativos los aislamientos predominantes 35,1 % (20/57), representados por Pseudomonas aeruginosa. El tiempo de cumplimiento de antibióticos fue 4 - 12 horas desde el inicio de fiebre. Mortalidad ocurrió por enfermedad de base mal controlada. Conclusiones: Cumplimiento de antibióticos durante la primera hora de fiebre neutropénica en pacientes pediátricos con cáncer disminuye complicaciones infecciosas, estancia hospitalaria y mortalidad.

Intensified treatments are associated with severe neutropenia, identified as a risk factor for infectious complications in patients with neoplastic diseases. Objective: To evaluate the importance of the moment of initiation of antibiotic treatment in the evolution and prognosis of patients with febrile neutropenia (NF) due to Cancer admitted to the Hospital de Niños J.M. de los Ríos between February 2020 - February 2022. Methods: Descriptive, prospective, cross-sectional, analytical study, a data collection form and Google Drive database were registered for statistical analysis by distribution of frequencies and percentages. Consent and Informed Assent were given to parents and patients, both approved by the Bioethics Commission, training in the management of neutropenic fever. It included patients with fever during the first hour after receiving chemotherapy, indicating antibiotics. Results: Male sex 63.2 % (36/57) of the cases of NF and preschoolers 43.9 % (25/57) were the most affected. Acute Lymphocytic Leukemia was the most frequent cancer 68.4 % (39/57) and Bacteremia 40.4 % (23/57) the predominant infectious pathology. They evolved satisfactorily in most cases; Mean hospital stay was 14.56 days, longer in patients with Acute Lymphocytic Leukemia in the induction phase. Gram-negative the predominant isolates 35.1 % (20/57), represented by Pseudomonas aeruginosa. Antibiotic compliance time was 4 - 12 hours from the onset of fever. Mortality occurred due to poorly controlled underlying disease. Conclusions: Antibiotic compliance during the first hour of neutropenic fever in pediatric patients with cancer reduces infectious complications, hospital stay and mortality.

Creación del primer biorrepositorio nacional de bacterias multirresistentes disponible para el estudio de la resistencia bacteriana en Chile

La disponibilidad de cepas bacteriana para el estudio de la resistencia bacteriana es clave para los avances en la investigación básica y clínica respecto del tema. Existen pocos biorrepositorios o bancos de bacterias con mecanismos de resistencia conocidos, aisladas de infecciones clínicamente significativas. Una revisión de la literatura revela que sólo en los Estados Unidos de América existe un biobanco de aislados resistentes disponibles para estudios. En esta publicación se cuenta cómo se creó el primer biorrepositorio de bacterias resistentes en Chile asociados a la Red de Laboratorios MICROB-R, con la participación de 11 centros distribuidos a lo largo del país, que a la fecha cuenta con más de 3.500 aislados bacterianos estudiados fenotípica y genotípicamente, disponibles para la comunidad científica chilena.

The availability of bacterial strains for the study of bacterial resistance is key to advances in basic and clinical research. There are few biobanks of bacteria with known resistance mechanisms, isolated from clinically significant infections. A review of the literature reveals that only in the United States of America is there a biobank of resistant isolates. This publication shows the creation of the first biorepository of resistant bacteria Chile associated with the MICROB-R Laboratory Network, with the participation of 11 centers distributed throughout the country, which to date has more than 3,500 bacterial isolates studied phenotypically and genotypically, available to the Chilean scientific community.

Neumomediastino espontáneo en un paciente con COVID-19. Reporte de caso / Spontaneous Pneumomediastinum in a Patient With COVID-19. Case Report

Resumen Dentro de las distintas complicaciones que se han descrito en pacientes con neumonía viral por SARS-CoV-2 tiene especial interés clínico el neumomediastino espontáneo (NE), por tratarse de una condición rara reportada en aproximadamente 1% de los pacientes con COVID-19. Se define por la presencia de aire en el mediastino en pacientes sanos o en ausencia de algún origen iatrogénico o traumático. Su presentación clínica suele ser insidiosa y puede acompañarse de otras complicaciones respiratorias. Presentamos el caso de un paciente con COVID-19 que durante su hospitalización desarrolló NE asociado a enfisema en regiones extratorácicas. No hubo presencia de enfisema subcutáneo ni neumotórax.

Abstract Among the different complications that have been described in patients with viral pneumonia due to SARS-CoV-2, spontaneous pneumomediastinum (SP) is of special clinical interest, as it is a rare condition reported in approximately 1% of patients with COVID-19. It is defined by the presence of air in the mediastinum in healthy patients or in the absence of any iatrogenic or traumatic origin. Its clinical presentation is usually insidious and may be accompanied by other respiratory complications. We present the case of a patient with COVID-19 who developed SP associated with emphysema in extrathoracic regions during hospitalization. There was no presence of subcutaneous emphysema or pneumothorax.

Factores de riesgo cardiovascular en pacientes en hemodiálisis / Cardiovascular risk factors in patients on hemodialysis

Introducción: La enfermedad cardiovascular es la primera causa de muerte en los pacientes con enfermedad renal crónica. En los hipertensos, la enfermedad renal crónica es la segunda causa de muerte, el daño vascular sistémico es la norma. Objetivo: Identificar los factores de riesgo cardiovascular tradicionales y no tradicionales y su asociación con la enfermedad cardiovascular en pacientes en hemodiálisis. Material y Métodos: Estudio de corte transversal en 247 pacientes en hemodiálisis crónica. Las variables analizadas fueron: causas de enfermedad renal crónica, factores de riesgo cardiovascular tradicionales y no tradicionales y enfermedades cardiovasculares. Se determinaron tablas de frecuencias y estadísticas de asociación mediante Chi cuadrado. Para determinar el riesgo de mortalidad se utilizó la razón de prevalencia (RP). Se consideró como nivel de significación estadística a p<0,05 con 95 % de confiabilidad. Resultados: Las causas de enfermedad renal crónica predominantes fueron la hipertensión arterial con 35,6 por ciento y la Diabetes Mellitus tipo 2 con 33,1 por ciento. Los pacientes hipertensos tuvieron más probabilidades de presentar una enfermedad cardiovascular con 2,63 veces mayor que el grupo de referencia. En los factores de riesgo cardiovascular no tradicionales la mayor probabilidad la presentaron los pacientes con proteína C reactiva elevada con 5,19 veces, seguido de la hiperuricemia con 3,79 veces y las alteraciones del producto calcio-fósforo con una probabilidad de 3,27 veces. Conclusiones: Los factores de riesgo cardiovasculares tradicionales se relacionan significativamente con la presencia de enfermedad cardiovascular(AU)

Introduction: Cardiovascular disease is the leading cause of death in patients with chronic kidney disease. In hypertensive patients, chronic kidney disease is the second cause of death, and systemic vascular damage has become the norm. Objective: To identify traditional and non-traditional cardiovascular risk factors and their association with cardiovascular disease in patients on hemodialysis. Material and Methods: Cross-sectional study conducted on 247 patients on chronic hemodialysis. The variables analyzed included: causes of chronic kidney disease, traditional and non-traditional cardiovascular risk factors, and cardiovascular diseases. Frequency tables and association statistics were determined by the chi-square test. The prevalence ratio (PR) was used to determine the risk of mortality. The level of statistical significance was considered to be at p value of less than 0,05 with a reliability of 95 percentResults: The most frequent causes of chronic kidney disease were arterial hypertension (35,6 percent) and type 2 diabetes mellitus (33,1 percen). Hypertensive patients were 2,63 times more likely to present cardiovascular disease than the reference group. In the case of non-traditional cardiovascular risk factors, the patients with elevated C-reactive protein were 5,19 more likely to develop cardiovascular disease, followed by those with hyperuricemia that were 3,79 more likely, and the patients with alterations in calcium and phosphorous who were 3,27 times more likely to suffer from this disease. Conclusions: Traditional cardiovascular risk factors are significantly related to the presence of cardiovascular disease(AU)

Masa vesicular hallazgo ecográfico / Vesicular mass ecographic find

Objetivos: Presentar una resección quirúrgica R0, con fines curativos de un cáncer de vesícula biliar estadio 1B. Caso Clínico: Femenina de 60 años de edad, sin antecedentes de relevancia, que presenta por estudios complementarios alta sospecha de cáncer de vesícula biliar (T2N0Mx), se realiza laparotomía exploradora con colecistectomía convencional, bisegmentectomía 4 b y 5 del hígado y vaciamiento ganglionar. Sin complicaciones con alta sanatorial al 4 día post operatorio. Conclusión: El diagnostico precoz y una cirugía temprana en el cáncer de vesicula biliar puede ser una herramienta fundamental para poder ofrecer al paciente una cirugía curativa en este tipo de patología

Objects: This paper introduces an R0 surgical resection in the treatment of stage 1B gallbladder cancer. Discussion: 60-year female patient without medical history with highly suspect gallbladder cancer (T2N0Mx), revealed by clinical exams. The patient underwent an exploratory laparotomy, a conventional cholecystectomy, a double segmentectomy for 4b-5 liver, and the lymph node was removed. Complications were not reported, and the patient was discharged four days after surgery. Conclusion: Early diagnosis and early surgery on gallbladder cancer patients may prove essential to cure such pathology

Uso de los factores de crecimiento presentes en el plasma rico en plaquetas como un tratamiento alternativo de lesiones músculo esqueléticas en animales / Use of growth factors present in platelet-rich plasma as an alternative treatment for musculoskeletal lesions in animals / Uso de fatores de crescimento presentes no plasma rico em plaquetas como tratamento alternativo para lesões musculo esqueléticas em animais

Resumen Se realizó una revisión sistemática del uso de plasma rico en plaquetas (PRP) en animales, seleccionando 105 artículos de referencia, publicados en los últimos 8 años (2012 a 2020) de las revistas Veterinary Medicine International, Scientific Reports, BMC Veterinary Research, Platelets, Biomedicine and Pharmacotherapy entre otras y validadas en las siguientes bases de datos: Pubmed, Web of Science, Sciencedirect, Scielo, Medline, Embase y Scopus. Limitando solo las revistas con altos rankings ayudados con las clasificaciones de revistas por scimago journal. Solo 35 artículos cumplieron los criterios de selección; articulándolo con necesidades actuales en la medicina veterinaria, buscando una nueva biotecnología y proyectándose hacia la medicina regenerativa, basándose en reconstrucción de tejidos vivos para contrarrestar daño o remplazo de función de órganos lesionados. Una de estas herramientas es el plasma rico en plaquetas (PRP) con sus factores de crecimiento (FC) Transformante ß (TGF ß), fibroblástico básico (FGFb), derivado de plaquetas (PDGF), del endotelio vascular (VEGF), tejido conectivo (CTGF) y epidérmico (EGF). Actualmente el (PRP) es un bioestimulante tomado como base por estudios en medicina humana y medicina veterinaria, observando su efectividad en el proceso de consolidación ósea en pacientes clínicos. Se recogieron evidencias científicas presentadas en literatura médica con respecto al PRP como una alternativa de tratamiento en el manejo de fracturas y lesiones músculo esqueléticas, con ello se logra determinar la importancia de la estandarización del procedimiento (PRP) en uso, preparación, almacenamiento y administración.

Abstract A systematic review of platelet-rich plasma (PRP) use in animals was carried out by taking 105 reference articles published during the last 8 years (2012 to 2020) in Veterinary Medicine International, Scientific Reports, BMC Veterinary Research, Platelets, Biomedicine and Pharmacotherapy; they were validated in the following databases: PubMed, Web of Science, ScienceDirect, SciELO, Medline, Embase and Scopus. The search was limited to just journals having a high impact factor; the SCImago journal rank (SJR) indicator (i.e. a sophisticated citation analysis algorithm) was also used. Only 35 of these articles met the selection criteria: i.e. coordinating content with current needs in veterinary medicine, seeking new biotechnological approaches and promoting regenerative medicine based on reconstructing living tissue to counteract damage or replace injured organs' function. One such tool is platelet-rich plasma (PRP) with its derivative growth factors (GF): transforming growth factor-ß (TGF-ß), basic fibroblast growth factor (bFGF), platelet-derived growth factor (PDGF), vascular endothelial growth factor (VEGF), connective tissue growth factor (CTGF) and epidermal growth factor (EGF). PRP is currently used as a biostimulant, acting as the basis for human and veterinary medicine studies; its effectiveness regarding bone/fracture healing/regeneration in clinical patients has been observed. Scientific evidence in the pertinent medical literature regarding PRP as an alternative treatment for managing fractures and musculoskeletal injuries was collected, thereby determining the importance of standardising the PRP procedure regarding its use, preparation, storage and administration.

Resumo Foi realizada uma revisão sistemática da utilização de plasma rico em plaquetas (PRP) em animais, com 105 artigos de referência, publicados nos últimos 8 anos (2012 a 2020) das revistas Veterinary Medicine International, Scientific Reports, BMC Veterinary Research, Platelets, Biomedicina e Farmacoterapia entre outros e validados nas seguintes bases de dados: Pubmed, Web of Science, Sciencedirect, Scielo, Medline, Embase e Scopus. Limitar apenas os periódicos com classificações altas ajudou com as classificações de periódicos pelo jornal scimago. Dos quais apenas 35 artigos atenderam aos critérios de seleção; articulando-se com as necessidades atuais da medicina veterinária, buscando uma nova biotecnologia e projetando-se na medicina regenerativa, baseada na reconstrução de tecidos vivos para neutralizar danos ou substituição de função de órgãos lesados. Uma dessas ferramentas é o plasma rico em plaquetas (PRP) com seus fatores de crescimento (FC) ß transformador (TGF ß), fibroblasto básico (FGFb), derivado de plaquetas (PDGF), endotelial vascular (VEGF), tecido conjuntivo (CTGF) e epidérmico (EGF). Atualmente (PRP) é um bioestimulante tomado como base para estudos em medicina humana e veterinária, observando sua eficácia no processo de consolidação óssea em pacientes clínicos. Foram coletadas evidências científicas apresentadas na literatura médica a respeito do PRP como alternativa de tratamento no manejo de fraturas e lesões musculoesqueléticas, determinando a importância da padronização do procedimento (PRP) no uso, preparo, armazenamento e administração.

Diagnóstico de nefrosclerosis en fallecidos autopsiados / Diagnosis of nephrosclerosis in autopsied deceased

Introducción: La nefrosclerosis se produce debido al daño de la microvasculatura glomerular. El daño vascular a nivel glomerular, reduce su capacidad funcional y el daño se acelera debido a la hipertensión arterial, diabetes mellitus, obesidad y otros causantes de daño renal. Objetivo: Identificar el diagnóstico histopatológico de nefrosclerosis y describir características de fallecidos autopsiados con esta entidad. Métodos: Fueron analizados 135 449 fallecidos autopsiados en Cuba, de 15 o más años de edad, entre los años 1963 y 2015, se revisaron los diagnósticos histopatológicos de nefrosclerosis. Se precisaron además los diagnósticos de causa directa de muerte y de causa básica de muerte, así como su asociación con otras entidades. Se analizó además: edad, sexo, diagnóstico histopatológico de nefrosclerosis, diagnósticos de causa directa y básica de muerte, y asociación con otras entidades patológicas. Resultados: Hubo diagnóstico histopatológico de nefrosclerosis en 56 422 (40,2 por ciento), de ellos el 91,8 por ciento tenían 55 o más años de edad, el 52,9 por ciento fue del sexo masculino y el 47,0 por ciento femenino. La bronconeumonía (25,88 por ciento) fue la principal causa directa de muerte, los trastornos ateroscleróticos y la hipertensión arterial se identificaron como las principales causas básicas de muerte. Conclusiones: Hubo un elevado porcentaje de diagnósticos de nefrosclerosis en los fallecidos autopsiados en Cuba, en un período de 52 años. Predominaron los pacientes mayores de 55 años, del sexo masculino, así como la asociación con enfermedades básicas ateroscleróticas e hipertensión arterial(AU)

Introduction: Nephrosclerosis occurs due to damage to the glomerular microvasculature. Vascular damage at the glomerular level reduces its functional capacity and the damage is accelerated due to high blood pressure, diabetes mellitus, obesity and other causes of kidney damage. Objective: To identify the histopathological diagnosis of nephrosclerosis and describe characteristics of autopsied deceased with this entity. Methods: 135,449 autopsied deceased in Cuba, aged 15 or over, between 1963 and 2015 were analyzed, the histopathological diagnoses of nephrosclerosis were reviewed. The diagnoses of direct cause of death and basic cause of death were also specified, as well as their association with other entities. It was also analyzed: age, sex, histopathological diagnosis of nephrosclerosis, diagnoses of direct and basic cause of death, and association with other pathological entities. Results: There was a histopathological diagnosis of nephrosclerosis in 56,422 (40.2 percent), of them 91.8 percent were 55 years of age or older, 52.9 percent were male and 47.0 percent female. Bronchopneumonia (25.88 percent) was the main direct cause of death, atherosclerotic disorders and arterial hypertension were identified as the main basic causes of death. Conclusions: There was a high percentage of nephrosclerosis diagnoses in autopsied deceased in Cuba, in a period of 52 years. Male patients over 55 years of age predominated, as well as the association with basic atherosclerotic diseases and arterial hypertension(AU)

Infecciones del Tracto Urinario: métodos diagnósticos, tratamiento empírico y multirresistencia en una Unidad de Adultos Área de Emergencias / Urinary Tract Infections: diagnostic methods, empirical treatment and multidrug resistance in an Adult Emergency Area Unit

INTRODUCCIÓN. Las infecciones del tracto urinario por variedad de bacterias uropatógenas multiresistentes se deben al uso de tratamiento empírico o automedicación. OBJETIVO. Describir en las infecciones de tracto urinario los métodos diagnósticos, tratamiento empírico y la multirresistencia. MATERIALES Y MÉTODOS. Estudio observacional, descriptivo, retrospectivo. Población y muestra de 73 Historias Clínicas de pacientes atendidos en la Unidad de Adultos Área de Emergencias del Hospital de Especialidades Carlos Andrade Marín en el período enero a diciembre 2018. Se incluyeron pacientes mayores de 18 años, de ambos sexos, con diagnóstico clínico y por laboratorio de infección del tracto urinario superior e inferior. La información se obtuvo mediante la base de datos AS400, y se procesó en Epi-info y Excel. RESULTADOS. El 71,23% (52; 73) de mujeres tuvieron infección del tracto urinario. Escherichia coli fue frecuente en un 48,39% (15; 31), con mayor resistencia al Clotrimoxazol. El tratamiento empírico con Ciprofloxacino fue utilizado en 27,40% (20; 73). DISCUSIÓN: Se observó controversia en los tipos de estudios de imagen solicitados para el diagnóstico acorde a la clase de infección de tracto urinario así como el tratamiento empírico por factores propios de cada localidad que evitaron resistencia. CONCLUSIÓN. Escherichia coli se aisló de manera frecuente y registró mayor resistencia al Clotrimoxazol; el principal antibiótico prescrito como tratamiento empírico fue la Ciprofloxacina; el examen más solicitado fue la Urotomografía.

INTRODUCTION. Urinary tract infections due to a variety of multi-resistant uropathogenic bacteria are due to the use of empirical treatment or self-medication. OBJECTIVE. Describe diagnostic methods, empirical treatment and multidrug resistance in urinary tract infections. MATERIALS AND METHODS. Observational, descriptive, retrospective study. Population and sample of 73 Medical Records of patients treated in the Emergency Area Adult Unit of the Carlos Andrade Marín Specialty Hospital in the period january to december 2018. Patients older than 18 years of age, of both sexes, with clinical diagnosis and due to upper and lower urinary tract infection laboratory. The information was obtained through the AS400 database, and was processed in Epi-info and Excel. RESULTS. 71,23% (52; 73) of women had urinary tract infection. Escherichia coli was frequent in 48,39% (15; 31), with greater resistance to Clotrimoxazole. Empirical treatment with Ciprofloxacin was used in 27,40% (20; 73). DISCUSSION: Controversy was observed in the types of imaging studies requested for diagnosis according to the class of urinary tract infection as well as the empirical treatment due to factors specific to each locality that prevented resistance. CONCLUSION. Escherichia coli was frequently isolated and showed greater resistance to Clotrimoxazole; the main antibiotic prescribed as empirical treatment was Ciprofloxacin; the most requested examination was the Urotomography.

Integral Velocidade-Tempo da Insuficiência Aórtica: Um Novo Marcador Ecocardiográfico na Avaliação da Gravidade da Insuficiência Aórtica / Velocity-Time Integral of Aortic Regurgitation: A Novel Echocardiographic Marker in the Evaluation of Aortic Regurgitation Severity

Resumo Fundamento A ecocardiografia é essencial para o diagnóstico e a quantificação da insuficiência aórtica (IA). A integral velocidade-tempo (IVT) do fluxo da IA pode estar relacionada à gravidade da IA. Objetivo Este estudo tem por objetivo avaliar se a IVT é um marcador ecocardiográfico de gravidade da IA. Métodos Foram incluídos todos os pacientes com IA nativa moderada ou grave e ritmo sinusal que visitaram o nosso laboratório de imagem entre janeiro e outubro de 2016. Todos os indivíduos foram submetidos a um ecocardiograma completo com medição da IVT da IA. A associação entre a IVT e a gravidade da IA foi analisada por regressão logística e modelos de regressão multivariada. Valores p<0,05 foram considerados estatisticamente significativos. Resultados Entre os 62 pacientes incluídos (68,5±14,9 anos; 64,5%: IA moderada; 35,5%: IA grave), a IVT foi maior em indivíduos com IA moderada em comparação àqueles com IA grave (2,2±0,5 m versus 1,9±0,5 m, p=0,01). Pacientes com IA grave apresentaram valores maiores de diâmetro diastólico final do ventrículo esquerdo (DDFVE) (56,1±7,1 mm versus 47,3±9,6 mm, p=0,001), volume diastólico final do ventrículo esquerdo (VDFVE) (171±36,5 mL versus 106±46,6 mL, p<0,001), orifício regurgitante efetivo (0,44±0,1 cm2 versus 0,18±0,1 cm2, p=0,002) e volume regurgitante (71,3±25,7 mL versus 42,5±10,9 mL, p=0,05), assim como menor fração de ejeção do ventrículo esquerdo (FEVE) (54,1±11,2% versus 63,2±13,3%, p=0,012). A IVT mostrou ser um marcador de gravidade da IA, independentemente do DDFVE, VDFVE e FEVE ( odds ratio 0,160, p=0,032) e da frequência cardíaca e pressão arterial diastólica (PAD) ( odds ratio 0,232, p=0,044). Conclusões A IVT do fluxo da IA apresentou associação inversa com a gravidade da IA, independentemente do diâmetro e volume do ventrículo esquerdo, frequência cardíaca, PAD e FEVE. A IVT pode ser um marcador de gravidade da IA em pacientes com IA nativa e ritmo sinusal. (Arq Bras Cardiol. 2020; [online].ahead print, PP.0-0)

Abstract Background Echocardiography is essential for the diagnosis and quantification of aortic regurgitation (AR). Velocity-time integral (VTI) of AR flow could be related to AR severity. Objective This study aims to assess whether VTI is an echocardiographic marker of AR severity. Methods We included all patients with moderate or severe native AR and sinus rhythm who visited our imaging laboratory from January to October 2016. All individuals underwent a complete echocardiogram with AR VTI measurement. The association between VTI and AR severity was analyzed by logistic regression and multivariate regression models. A p-value<0,05 was considered statistically significant. Results Among the 62 patients included (68.5±14.9 years old; 64.5%: moderate AR; 35.5%: severe AR), VTI was higher in individuals with moderate AR compared to those with severe AR (2.2±0.5 m vs. 1.9±0.5 m, p=0.01). Patients with severe AR presented greater values of left ventricular end-diastolic diameter (LVEDD) (56.1±7.1 mm vs. 47.3±9.6 mm, p=0.001), left ventricular end-diastolic volume (LVEDV) (171±36.5 mL vs. 106±46.6 mL, p<0.001), effective regurgitant orifice (0.44±0.1 cm2vs. 0.18±0.1 cm2, p=0.002), and regurgitant volume (71.3±25.7 mL vs. 42.5±10.9 mL, p=0.05), as well as lower left ventricular ejection fraction (LVEF) (54.1±11.2% vs. 63.2±13.3%, p=0.012). The VTI proved to be a marker of AR severity, irrespective of LVEDD, LVEDV, and LVEF (odds ratio 0.160, p=0.032) and of heart rate and diastolic blood pressure (DBP) (odds ratio 0.232, p=0.044). Conclusions The VTI of AR flow was inversely associated with AR severity regardless of left ventricular diameter and volume, heart rate, DBP, and LVEF. VTI could be a marker of AR severity in patients with native AR and sinus rhythm. (Arq Bras Cardiol. 2020; [online].ahead print, PP.0-0)

Birth of healthy neonate following preimplantation genetic diagnosis in a mother with mosaic Turner syndrome. Case report and review of the literature / Recién nacido sano después de diagnóstico genético preimplantatorio en una madre con síndrome de turner mosaico. reporte de caso y revisión de la literatura

RESUMEN Objetivos: reportar el caso de una paciente con síndrome de Turner en mosaico, a quien se le realizó un tratamiento de reproducción asistida con análisis genético preimplantatorio para aneuploidias, logrando el nacimiento de una niña sana con cariotipo normal, y realizar una revisión de la literatura sobre la utilidad del diagnóstico genético preimplantatorio en las mujeres con síndrome de Turner. Materiales y métodos: se presenta el caso de una mujer de 27 años, con diagnóstico de síndrome de Turner en mosaico y con alteración secundaria en la reserva ovárica, atendida en centro de referencia para el manejo de infertilidad en Medellín, Colombia, a quien se le realizó un tratamiento de fertilización in vitro con análisis genético preimplan-tatorio para prevenir la transmisión del síndrome de Turner a su descendencia. Se realizó una búsqueda de la literatura en las bases de datos Medline vía PubMed, Clinical Key, OVID, Embase, Lilacs, SciE- LO y Oxford Journals, con los siguientes términos: "Turner Syndrome", "Mosaic Turner", "Preim- plantation Genetic Screening", "Preimplantation Genetic Testing", "Preimplantation Genetic Diagnosis", "Pregnancy", "Successful pregnancy". Como criterios de inclusión se consideraron artículos tipo series y reportes de casos, cohortes y artículos de revisión desde enero de 1980 hasta junio de 2017, que incluyeran mujeres con síndrome de Turner embarazadas por medio de técnicas de fertilización in vitro, con sus propios óvulos, y que hubiesen sido sometidas a biopsia embrionaria para diagnóstico genético preimplantatorio. La búsqueda se limitó a los idiomas español e inglés. Resultados: un estudio cumplió con los criterios de inclusión. Tanto en este reporte como en nuestro caso, las pacientes con síndrome de Turner en mosaico se sometieron a varios ciclos de inyección intracitoplasmática de espermatozoides (ICSI) con sus propios óvulos, luego se realizó biopsia em- brionaria para análisis genético preimplantatorio utilizando diferentes técnicas. En ambos casos se logró la transferencia al útero de embriones euploides con el posterior nacimiento de niñas sanas con cariotipo normal. Conclusión: Las pacientes con ST mosaico podrían beneficiarse de la biopsia embrionaria y análisis genético preimplantatorio para prevenir la transmisión del defecto genético a su descendencia.

ABSTRACT Objectives: To report the case of a patient with mosaic Turner syndrome who underwent assisted reproduction treatment with preimplantation genetic testing for aneuploidy and gave birth to a healthy baby girl with normal karyotype; and to conduct a review of the literature on the usefulness of preimplantation genetic diagnosis in women with Turner syndrome. Materials and methods: A case of a 27 year-old woman diagnosed with mosaic Turner syndrome and secondary altered ovarian reserve, seen in a referral center for infertility management in Medellín, Colombia. The patient underwent in vitro fertilization followed by pre-implantation genetic testing to prevent transmission of Turner syndrome to her progeny. A literature search was conducted in the Medline via PubMed, Clinical Key, OVID, Embase, Lilacs, SciELO and Oxford Journals data- bases using the following terms: "Turner Syndrome," "Mosaic Turner," "Preimplantation Genetic Screening," "Preimplantation Genetic Testing," "Preimplantation Genetic Diagnosis," "Pregnancy," "Successful pregnancy." Inclusion criteria were case series and case reports, cohort studies and review articles published between January 1980 and June 2017 that included women with Turner syndrome achieving pregnancy by means of in vitro fertilization techniques with their own oocytes and who had undergone embryo biopsy for preimplantation genetic diagnosis. The search was limited to articles in Spanish and English. Results: one study met the inclusion criteria. Both in this report and in our case, patients with mosaic Turner syndrome underwent several cycles of intracytoplasmic sperm injection (ICSI) with their own eggs, then performed embryonic biopsy for preimplantation genetic analysis using different techniques. In both cases, euploid embryos were transferred to the uterus with the subsequent birth of healthy girls with normal karyotype. Conclusion: Patients with mosaic Turner syndrome could benefit from preimplantation biopsy and genetic analysis to prevent transmission of the genetic defect to their progeny.

Estudio climatológico de los vientos para la ciudad de Bogotá en el periodo 2010 - 2016 / Climatological study of the winds for the city of Bogotá in the period 2010-2016 / Estudo climatológico dos ventos para a cidade de Bogotá no período de 2010 a 2016

Resumen En Colombia, hay una carencia en los estudios climatológicos del viento, ya que, los que existen actualmente no aplican técnicas estadísticas ni periodos representativos adecuados. Por consiguiente, el presente estudio analiza el comportamiento climatológico del viento en la ciudad de Bogotá, para el periodo 2010 a 2016, buscando describir estadística, espacial y vectorialmente esta variable climatológica. Para empezar se realizó un análisis estadístico del conjunto de datos, de la velocidad del viento, mediante el software Windographer©, utilizando las técnicas exploratorias para la distribución Weibull, describiendo así los parámetros estadísticos de las estaciones en las principales zonas de la ciudad. Del mismo modo, se elaboraron las rosas de los vientos por estación, con el software WRPLOT™; y para finalizar se realizó un mapa vectorial mediante el método de interpolación Co-Kriging utilizando el sistema de información geográfica ArcGis®. Observando que el régimen de circulación atmosférico en Bogotá está estrechamente relacionado con la presencia de los cerros orientales y con la predominancia de los vientos alisios; así mismo, se encontró que la mayor velocidad del viento se presenta al suroeste, y las magnitudes más débiles, al norte y en cercanía a los cerros orientales.

Abstract In Colombia, there is a lack in wind weather studies, since those that currently exist do not apply statistical techniques or adequate representative periods. Therefore, the present study analyzes the wind weather behavior in the city of Bogotá, for the period 2010 to 2016, seeking to describe this weather variable statistically spatially and vectorially. To begin with, a statistical analysis of the data set, of the wind speed, was performed using the Windographer© software, using the exploratory techniques for the Weibull distribution, thus describing the statistical parameters of the stations in the main areas of the city. Similarly wind roses were made per season, using the WRPLOT ™ software; and, finally, a vector map was made using the Co-Kriging interpolation method, using the ArcGis® geographic information system. Noting that the atmospheric circulation regime in Bogotá is closely related to the presence of the eastern hills and the predominance of trade winds; Likewise, it was found that the highest wind speed is presented to the southwest, and the weakest magnitudes, to the north and in proximity to the eastern hills.

Resumo Na Colômbia, há falta de estudos sobre o clima do vento, uma vez que os existentes atualmente não aplicam técnicas estatísticas ou períodos representativos adequados. Portanto, o presente estudo analisa o comportamento do clima eólico na cidade de Bogotá, no período de 2010 a 2016, buscando descrever esta variável climática de forma estatística, espacial e vetorial. Para começar foi realizada uma análise estatística do conjunto de dados, da velocidade do vento, utilizando o software Windographer©, utilizando as técnicas exploratórias para a distribuição de Weibull, descrevendo assim os parâmetros estatísticos das estacoes nas principais áreas da cidade. Da mesma forma, foram feitas rosas de vento por temporada, usando o software WRPLOT ™; e, finalmente, foi feito um mapa vetorial usando o método de interpolação Co-Kriging, usando o sistema de informação geográfica ArcGis®. Observando que o regime de circulação atmosférica em Bogotá está intimamente relacionado com a presença dos montes orientais e predominância de ventos alísios; da mesma forma, verificou-se que a maior velocidade do vento é apresentada na região sudeste, e as magnitudes mais fracas, ao norte e nas proximidades das colinas orientais.

Conocimientos y actitudes hacia la violencia de género en profesionales de la salud mental / Knowledge and attitudes towards gender-based violence in mental health professionals

Introdución: en el mundo, la violencia de género es un problema grave de salud pública, constituye además un atentado a los derechos humanos de las mujeres. El maltrato físico y sexual ha sido vinculado al desarrollo de problemas de salud mental.Los conocimientos y las actitudes que los profesionales de la salud tienen acerca del problema impactan en la atención a las mujeres que sufren violencia. Objetivo: evaluar los conocimientos y las actitudes hacia la violencia de género en profesionales de la salud mental de una clínica psiquiátrica de San Luis Potosí, México. Material y métodos: estudio descriptivo, cuantitativo, prospectivo, transversal, realizado en 72 profesionales de la salud que laboran en una clínica psiquiátrica. Se aplicó un cuestionario ad hoc para evaluar conocimientos y actitudes. Resultados: la población estudiada presentó un conocimiento deficiente; sin embargo, se encontró una actitud favorable al problema de la violencia. Conclusión: la violencia de género requiere para su abordaje, profesionales sensibles y empáticos, por ello, las instituciones de salud deben desarrollar estrategias dirigidas a la mejora de sus cono-cimientos, competencias y habilidades; a fin de que ofrezcan una atención integral y digna a las mujeres que sufren violencia.

Infección fúngica invasiva / Invasive fungal infection

Introducción: Las infecciones fúngicas invasivas son producidas casi universalmente por Candida o Aspergillus, pero se identifican otros hongos que requieren abordajes individualizados, principalmente en pacientes inmunocomprometidos. El micetoma es una enfermedad granulomatosa crónica, generalmente limitada a la piel y al tejido subcutáneo; sin embargo, existen localizaciones como la torácica y abdominal, consideradas de mal pronóstico, debido a una diseminación visceral. Objetivo: Mostrar otra alternativa de diseminación visceral de un micetoma, en un paciente que fue sometido a un trasplante renal. Caso clínico: Paciente que se sometió a un trasplante de riñón de un donante de cadáver. Se le diagnosticó micetoma por Candida albicans en el brazo derecho y daño pulmonary. Tuvo buena respuesta al tratamiento. Comentarios: Las infecciones fúngicas invasivas son cada vez más frecuentes en la práctica clínica, especialmente en pacientes inmunodeprimidos. En la actualidad, hay nuevos medicamentos disponibles que son útiles para el tratamiento de estos pacientes, pero el pronóstico continúa siendo desalentador en muchos casos. Estas entidades tienen la capacidad de afectar a diferentes órganos, lo cual condiciona un compromiso grave para el paciente(AU)

Introduction: Invasive fungal infections are almost universally produced by Candida or Aspergillus, but other fungi are identified that require individualized approaches, mainly in immunocompromised patients. Mycetoma is a chronic granulomatous disease, usually limited to the skin and subcutaneous tissue; however, there are localizations such as the thoracic and abdominal, considered of poor prognosis due to a visceral dissemination. Objective: To show another alternative of visceral dissemination of a mycetoma in a patient who underwent a kidney transplant. Clinical case: We report the case of a female patient who underwent a kidney transplant from a cadaveric donor. She had a diagnosis of Candida albicans mycetoma in the right arm and lung damage. She had a good response to treatment. Comments: Invasive fungal infections are becoming more frequent in clinical practice, especially affecting immunosuppressed patients. At present, new drugs are available that are useful in the treatment of these patients, but the prognosis continues to be discouraging in many cases. These infections have the capacity to affect different organs, which determines a serious problem for the patient(AU)

Introducción, epidemiología y diagnóstico de la enfermedad de Parkinson / Introduction, epidemiology and diagnosis of Parkinson's disease

RESUMEN La enfermedad de Parkinson es un trastorno neurodegenerativo que tiene múltiples manifestaciones motoras y no motoras. El proceso patológico inicia años o décadas antes del debut de los síntomas no motores, tiempo en el que se desarrollan otros síntomas que muy frecuentemente preceden el inicio clínico. Si bien se ha avanzado mucho en el conocimiento sobre la patogénesis y en el reconocimiento de las numerosas manifestaciones no motoras, el diagnóstico se sigue centrando en el síndrome motor o parkinsonismo. En este capítulo se muestra una actualización sobre datos recientes relacionados con el incremento en la prevalencia mundial de la enfermedad, así como el diagnóstico basado en los nuevos criterios definidos por la Sociedad Internacional de Trastornos del Movimiento en 2015, que se basan en los criterios centrales pero tienen en cuenta banderas rojas para la posible existencia de otros parkinsonismos, criterios de exclusión absoluta y criterios de soporte, éstos últimos reconociendo la utilidad de los síntomas no motores y de algunas ayudas paraclínicas para soportar el diagnóstico in vivo.

SUMMARY Parkinson's disease is a neurodegenerative disorder that has multiple motor and non-motor manifestations. The pathological process begins years or decades before the onset of non-motor symptoms, at which time other symptoms develop that frequently precede clinical debut. Although much progress has been made in the knowledge of pathogenesis and in the recognition of the numerous non-motor manifestations, the diagnosis is still focused on motor syndrome or parkinsonism. This chapter shows an update on recent data related to the increase in the global prevalence of the disease, as well as the diagnosis based on the new criteria defined by the Movement Disorders Society in 2015, which focus on the central criteria but defined red flags for the possible existence of other parkinsonisms, absolute exclusion criteria and support criteria, the latter recognizing the utility of non-motor symptoms and some paraclinical aids to support in vivo diagnosis.

Epanorin, a lichen secondary metabolite, inhibits proliferation of MCF-7 breast cancer cells

BACKGROUND: Epanorin (EP) is a secondary metabolite of the Acarospora lichenic species. EP has been found in lichenic extracts with antimicrobial activity, and UV-absorption properties have been described for closely related molecules; however, its antiproliferative activity in cancer cells has not yet been explored. It has been hypothesized that EP inhibits cancer cell growth. MCF-7 breast cancer cells, normal fibroblasts, and the non-transformed HEK-293 cell line were exposed to increasing concentrations of EP, and proliferation was assessed by the sulforhodamine-B assay. RESULTS: MCF-7 cells exposed to EP were examined for cell cycle progression using flow cytometry, and DNA fragmentation was examined using the TUNEL assay. In addition, EP's mutagenic activity was assessed using the Salmonella typhimurium reverse mutation assay. The data showed that EP inhibits proliferation of MCF-7 cells, and it induces cell cycle arrest in G0/G1 through a DNA fragmentation-independent mechanism. Furthermore, EP's lack of overt cytotoxicity in the normal cell line HEK-293 and human fibroblasts in cell culture is supported by the absence of mutagenic activity of EP. CONCLUSION: EP emerges as a suitable molecule for further studies as a potential antineoplastic agent.